Вообще, "наценка" - это понятие, используемое бухгалтерией или торговыми фирмами . Это если Вы материалы продавали бы, а не работали по договору подряда.
Если Вы подрядчик по договору подряда, для смет и актов КС-2 актуальна вещь под названием "Транспортные и заготовительно складские расходы".
Про эти вещи четко написано в "библии" сметчиков - МДС 81-35.2004, пункты 4.24- 4.25. А подробное описание как это дело считать - с примерами расчетом и т.д. - МДС81.2.99. Если коротко :
Есть стоимость материалов оптовая и есть стоимость материалов сметная. Это разные вещи.
Различие сметной и оптовой стоимости материалов отражено формулой :
СМ=(О+ТР)*ЗСР, где : СМ - сметная стоимость материалов, О-оптовая стоимость материалов ( взятая из прайсов), ТР - транспортные расходы, ЗСР - заготовительно-складские расходы.
В смете у Вас должна быть сметная стоимость материалов. В прайсах у Вас - оптовая цена. Включив в сметы стоимости материалов по прайсам, Вы составили неправильную смету-забыли транспортные и заготовительно-складские расходы.
Если есть возможность поправить ( в смете или на стадии КС-2) - правьте, основания у Вас есть.
Только называйте все правильно, по сметному.
Если заказчик не попросит с Вас расчет транспортных затрат, то можно в конце сметы добавить строчку " Транспортные и ЗС расходы. Из моего опыта - на кабельную продукцию, если возить не очень далеко и не мелкими партиями , то это не больше 3 %. А на бетон, например, если на 100 км возить - около 25%.